Determinação de trechos genômicos específicos para seleção de oligonucleotídeos iniciadores usando famílias de proteínas e sequências características

• Ano de defesa: 2015
• Autor(a) principal: Cardoso, Rodrigo Andrade
• Orientador(a): Almeida Jr., Nalvo Franco de
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Genômica; Genomics; Reação em Cadeia da Polimerase; Polymerase Chain Reaction; Biologia Molecular; Molecular Biology; Computação; Computer Science
• Link de acesso: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/2611

Com o sequenciamento mais frequente de genomas, várias técnicas de comparação têm sido propostas, com inúmeras aplicações. Este trabalho propõe uma técnica computacional baseada em sequências características e na construção de famílias de proteínas para determinar trechos de um genoma que contenham candidatos a oligonucleotídeos iniciadores específicos desse genoma, quando comparado com outros. Os trechos determinados pela metodologia proposta podem ser usados como entrada para ferramentas que encontram oligonucleotídeos iniciadores específicos. Testes revelaram que a metodologia se mostrou muito efetiva para genomas de espécies diferentes.