Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2016 |
| Autor(a) principal: |
Nascimento, André Vieira do
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| Orientador(a): |
Grisolia, Alexeia Barufatti
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| Banca de defesa: |
Borquis, Rusbel Raul Aspilcueta
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Utsunomiya, Adam Taiti Harth
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Pereira, Anirene Galvão Tavares
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| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal da Grande Dourados
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| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de pós-graduação em Biologia Geral/Bioprospecção
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| Departamento: |
Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: |
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| Palavras-chave em Inglês: |
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| Área do conhecimento CNPq: |
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| Link de acesso: |
http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/1454
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Resumo: |
A bovinocultura de corte exerce grande impacto sobre a economia brasileira, trazendo à necessidade de animais mais produtivos, capazes de manter crescente a linha de produção, sem a conversão de importantes biomas em áreas de pastagem. Assim, justifica-se o estudo de associação genômica ampla (GWAS), destinado à identificação de marcadores associados aos fenótipos de idade ao primeiro parto (IPP) e peso em diferentes idades para bovinos Nelore. O grupo amostral foi decomposto em G1, contendo 2273 animais (995 machos e 1278 fêmeas) genotipados para mais de 777.000 marcadores e G2 (522 fêmeas) genotipados em painel com densidade superior a 50.000 marcadores, que tiveram os genótipos imputados para painel mais denso. Os dados genômicos foram submetidos ao controle de qualidade, visando remoção de marcadores ou amostras viesados, antes e após a imputação. Os marcadores foram organizados em blocos haplotípicos, contendo 5 marcadores cada. Para IPP o GWAS foi realizado a partir de duas metodologias de metanálise, a primeira considerou as populações independentes entre modelagens e a segunda a existência de correlação entre as populações. Para os fenótipos de peso, o estudo de associação foi baseado em modelo linear misto. Os resultados foram expostos em Manhattan plot. Aqueles haplótipos cujos efeitos estimados apresentaram-se maiores e/ou significativos, foram explorados para examinar a proximidade com genes e QTLs bovinos catalogados. Para características reprodutivas foram encontrados 9 genes e 45 QTLs para matanálise 1 enquanto para metanálise 2, 11 genes e 129 QTLs. Foi possível identificar para as características de peso ao nascimento, peso a desmama, peso à sobreano, ganho de peso do nascimento ao desmame e ganho de peso do desmame ao sobreano, respectivamente, 7, 9, 4, 4 e 5 genes. Quanto aos QTLs, 25 apresentaram função biológica associada à característica de peso. O GWAS utilizando a abordagem de alelos haplotípicos, mostrou-se eficiente na busca por variantes genéticas associadas aos fenótipos de interesse. |
