Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2022 |
| Autor(a) principal: |
Santos, Felice Deminco Alves
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| Orientador(a): |
Alves, Carlos Roberto Brites
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| Banca de defesa: |
Campos, Gubio Soares
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Bahia, Fabianna Márcia Maranhão
,
Vaz, Sara Nunes
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| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal da Bahia
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| Programa de Pós-Graduação: |
Pós-Graduação em Medicina e Saúde (PPGMS)
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| Departamento: |
Faculdade de Medicina da Bahia
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: |
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| Área do conhecimento CNPq: |
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| Link de acesso: |
https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38117
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Resumo: |
Introdução: A COVID-19 é a nova doença causada por um coronavírus humano, cujo agente etiológico é o SARS-CoV-2. Dois anos se passaram e o SARS-CoV-2 possui uma grande diversidade genética, a qual favoreceu ao surgimento de variantes emergenciais durante diversos períodos da pandemia. Devido a importância empregada na vigilância viral e as limitações encontradas nas plataformas de sequenciamento de nova geração, o objetivo desse trabalho foi identificar a variabilidade na região de Spike do SARS-CoV-2, a partir de uma plataforma de sequenciamento de Sanger, em pacientes com COVID-19 atendidos pelo Hospital Universitário Professor Edgard Santos em Salvador-BA. Métodos: Trata-se de um estudo observacional transversal com amostras preservadas, positivas para SARS-CoV-2, de indivíduos maiores de 18 anos, funcionários ou pacientes, atendidos no Hospital Universitário Professor Edgard Santos (HUPES). Todas as amostras dos participantes envolvidos foram confirmadas para COVID-19 por um ensaio de RT-qPCR. O material genético viral extraído foi utilizado para um ensaio de NESTED-PCR no gene S do SARS-CoV-2 e os resultados revelados em gel de agarose a 1,5%. A reação de sequenciamento utilizando o BigDye Terminator V3.1 Cycle Senquencing kit foi realizada em uma região de 1.120 pares de base e o resultado dessa reação foi lido pelo equipamento de eletroforese capilar SeqStudio. Os arquivos das sequências geradas pelo equipamento foram analisados para a construção da sequência consenso a partir da sequência referência e identificação das mutações ao logo do genoma. Resultados: De todas as 103 amostras sequenciadas, 69 continham variantes relevantes representadas por 20 BA.1, 13 delta, 22 gama e 14 zeta, identificadas entre junho de 2020 e fevereiro de 2022. Todas as sequências encontradas foram alinhadas com sequências representativas do variantes. Conclusões: O protocolo desenvolvido por esse trabalho foi capaz de identificar e acompanhar a variabilidade do gene S do SARS-CoV-2 e, por consequência, identificar as variantes mais relevantes para a pandemia, podendo ser uma metodologia alternativa para vigilância molecular viral. |
