Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2023 |
| Autor(a) principal: |
Dias, Mayra Silva
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| Orientador(a): |
Pinto, Luís Fernando Batista |
| Banca de defesa: |
Pinto, Luís Fernando Batista,
Pedrosa, Victor Breno,
Carneiro, Paulo Luiz Souza |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA
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| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO)
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| Departamento: |
Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: |
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| Área do conhecimento CNPq: |
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| Link de acesso: |
https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38131
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Resumo: |
Os estudos usando fenótipos e pedigree mostram pouca variabilidade genética aditiva para o IDP. Entretanto, ainda não se tem estudos que agreguem os genótipos nessa avaliação em bovinos da raça Nelore. A adição de genótipos, permitirá avaliar a arquitetura genômica dessa complexa e importante característica. Assim, objetivou-se estimar a herdabilidade baseada em dados genômicos, realizar um estudo GWAS e funcional para IDP na raça Nelore. Os dados analisados foram cedidos das fazendas Katayama, sendo 12.599 registros de pedigree, 7.778 de fenótipos de IDP e 3.836 animais genotipados com chip Illumina 50k. Marcadores moleculares contidos nos cromossomos autossomos e no cromossomo X, foram utilizados nas análises. Para realizar o controle de qualidade dos dados genotípicos e análises de associação foram utilizados os pacotes da família BLUPF90, adotando o método da Melhor predição linear genômica não viesada de passo único. O nível de significância genômico foi de 2,55 x 10 -05, mas também foram avaliados SNPs significativos ao nível cromossômico. A média do IDP foi de aproximadamente 450,3 dias, com desvio-padrão de 134,1 dias e a amplitude total de 270 a 730 dias. As variâncias ambiental e genética foram de 8.986,6 e 369,20, respectivamente, com uma herdabilidade de aproximadamente 0,04 ± 0,04. A análise GWAS gerou p-valores que resultaram em um fator de inflação genômica (lambda) de 1,08. O único SNP (rs136725686) significativo em nível genômico (P = 1,532587e-06) foi localizado no cromossomo 13. Outros 19 SNPs foram significativos, em nível cromossômico, os quais estão distribuídos nos cromossomos 1, 2, 3, 6, 10, 13, 14, 17, 18, 22 e 26. Na região desses SNPs foram encontrados 32 genes, dentre os quais destacamos LYZL4, TEC, RAD21, SLC38A7, GOT2, CLPX, CCK, LMO4, NFATC2, SLC51B, TXK, BCAR3, UTP23, MTFMT, FOXP1 e TRAK1 como relevantes, pois foram previamente relacionados com fatores que podem afetar a reprodução. |
