Associação genômica ampla aplicada a variáveis de carcaça em ovinos Santa Inês.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Souza, Tatiana Cortez de lattes
Orientador(a): Pinto, Luís Fernando Batista
Banca de defesa: Pinto, Luís Fernando Batista, Costa, Raphael Bermal, Balieiro, Júlio César de Carvalho
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO)
Departamento: Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38378
Resumo: Cortes primários da carcaça, como lombo, pernil, paleta e costela afetam diretamente o valor comercial da carcaça dos ovinos. Assim, este trabalho teve como objetivo realizar um estudo de associação genômica ampla (GWAS) para o rendimento de cortes comerciais da carcaça de ovinos Santa Inês. Um total de 491 cordeiros foram genotipados com o Illumina Ovine SNP50 BeadChip e mensurados para os rendimentos de paleta, costela, lombo e pernil. Após o controle de qualidade, 490 animais e 44.996 marcadores foram utilizados na análise GWAS, pelo método WssGBLUB. As estimativas de herdabilidade foram 0,28 ± 0,004 (lombo), 0,32 ± 0,003 (paleta), 0,41 ± 0,001 (costela) e 0,46 ± 0,006 (pernil). Um total de 38 janelas genômicas explicaram > 1% da variância genética aditiva (VA) dos cortes comerciais, as quais foram localizadas nos cromossomos OAR1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9, 18, 20, 22, 24 e 26. Os VA explicados foram 13,1% (Pernil), 18,8% (Paleta), 19,2% (Lombo) e 20,1% (Costela). Os quatro principais picos foram encontrados nas janelas OAR1_36252750:37221480 (6,4% de VA para costela), OAR8_ 14238752:15227417 (5,1% de VA paleta), OAR18 _60775598:61772991 (5,8% de VA para lombo) e OAR20_ 18853816:19834355 (2,6% de VA para pernil). Foram encontrados 307 genes codificadores de proteínas, sendo 69, 61, 89 e 88 genes nas janelas relacionadas com lombo, costela, paleta e pernil, respectivamente. A análise de anotação funcional foi realizada para esses genes, o que resultou na identificação da via de interação ligante-receptor neuroativa como a única via significativa (P = 2,0E-7). Os cinco principais genes candidatos foram os seguintes: VEGFA, FGFR1, SLC2A1, TRND e MIR29A, os quais tem um papel fundamental no crescimento muscular. Futuros estudos envolvendo o sequenciamento desses genes necessitam ser realizados para identificar as variantes causais que afetam os rendimentos de corte comerciais em ovinos Santa Inês.