Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica

• Ano de defesa: 2009
• Autor(a) principal: Peixoto, Jean Charles da Cunha
• Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/6421264538330799
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso embargado
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Amazonas; Instituto de Ciências Biológicas; Brasil; UFAM; Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
• Palavras-chave em Português: Bacia Amazônica; Rio Solimões; Rio Negro; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
• Link de acesso: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707

Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqiiéncias foram analisadas pelos programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e célculo dos indices de diversidade e riqueza pelo programa SPADE. A afiliaqio taxonémica foi feita pela submissfio das seqfiéncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classifier do RDP II (Ribosomal Database Project). A érvore filogenética foi construfda pelo método Neighbor Joining pelo programa Mega, versfio 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas, nos dois ambientes. O rio Solimées apresentou maior diversidade de géneros bacterianos. enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior concentraqio de OTUs penencentes a um género bacteriano especffico, Polynucleobacter, acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bactérias nesses ambientes ainda pouco explorados.