Genes Humanos Sujeitos ao Imprinting Genômico: Caracterização In Silico do Imprintoma e Aplicações Forenses

• Ano de defesa: 2013
• Autor(a) principal: SANTIAGO, SAMARA CARDOSO DA SILVA
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual do Ceará
• Palavras-chave em Português: Biotecnologia
• Link de acesso: https://siduece.uece.br/siduece/trabalhoAcademicoPublico.jsf?id=91262

Imprinting genômico é um fenômeno epigenético no qual o fenótipo expresso <br/>por um gene varia dependendo de sua origem parental. As impressões genômicas <br/>servem de molde para sua própria replicação; são herdáveis; podem ser identificadas por <br/>análise molecular, e servem como marcadores diretos da ascendência de regiões <br/>genômicas. Estudos têm comprovado a importância do imprinting como marcador <br/>epigenético, o que incentiva o emprego dos genes impressos em genética forense, <br/>especialmente em casos de identificação de paternidade, complementando os <br/>marcadores genéticos clássicos, como os microssatélites. Nesse sentido, foi realizado <br/>um levantamento sobre as características estruturais e funcionais dos genes impressos <br/>(coletivamente denominados de “imprintoma”) a fim de se obter informações que <br/>venham a auxiliar na identificação humana forense por análise epigenética. Obteve-<br/>se a caracterização inédita do imprintoma humano, aqui identificado como um painel <br/>composto por 248 genes (120 reconhecidamente impressos e 128 candidatos), além de <br/>análises in silico de regiões diferencialmente metiladas (DMRs), de regiões de controle <br/>de imprinting (ICRs), e de polimorfismos uninucleotídicos (SNPs) existentes no <br/>imprintoma. Utilizando técnicas convencionais de bioinformática aliadas à <br/>disponibilidade de dados experimentais de estudos pan-genômicos (Genome-Wide <br/>Association Studies), e abordagens de Web Semântica e Linked Data, os genes <br/>impressos humanos foram examinados, compilados, estruturados e vinculados, <br/>visando seu uso como um recurso de compartilhamento para estudos genômicos e <br/>epigenômicos posteriores. A primeira versão do Imprintoma Humano foi publicada <br/>como uma iniciativa Linked Open Data (LOD) através da plataforma Data Hub <br/>(http://datahub.io/dataset/a-draft-version-of-the-linked-human-imprintome). A análise <br/>dos genes impressos permitiu também a associação de 24 deles à tríade “Diabesin”, <br/>denominação para a condição concomitante de diabetes, obesidade e inflamação. Por <br/>fim, o presente trabalho permitiu o requerimento de uma patente baseada na <br/>genotipagem de SNPs de loci impressos, denominada iSNPs (ou SNPs impressos), <br/>reivindicando propriedade intelectual sobre a técnica de identificação humana por <br/>análise combinada e haplotípica de polimorfismos uninucleotídicos existentes <br/>em loci do imprintoma. A presente tese demonstra a exequibilidade do emprego in <br/>silico de dados de sequenciamento genômico em larga-escala na extração de <br/>informações úteis e validáveis na detecção de marcadores epigenéticos, tais como os <br/>SNPs de genes impressos aqui reportados como representativos de vínculo genético <br/><br/><br/>&nbsp;<br/><br/>informativo. &nbsp;<br/>Palavras-chave: Imprinting Genômico; DNA Forense; SNP; Marcadores Epigenéticos; <br/>Amostras Vestigiais. <br/><br/>&nbsp;