Inferência filogenética do segmento genômico S completo dos hantavirus identificados no Brasil

• Ano de defesa: 2012
• Autor(a) principal: Silva, Alexandro Guterres da
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Laboratório de Computação Científica; Serviço de Análise e Apoio a Formação de Recursos Humanos; BR; LNCC; Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional
• Palavras-chave em Português: Estrutura molecular; Algoritmos genéticos; Molecular structure; Genetic algorithms; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAR
• Link de acesso: https://tede.lncc.br/handle/tede/164

No continente americano vários hantavírus causam síndrome pulmonar por hantavírus, um emergente e importante problema de saúde pública nas Américas. No Brasil, desde o primeiro surto da doença no inicio da década de 1990, mais de 1.440 casos já foram documentados em 14 dos 27 estados brasileiros, com uma taxa de letalidade de 40 a 70%. Curiosamente, apesar da ausência de notificação de casos, nos estados como Espírito Santo, Mato Grosso do Sul e Rio de Janeiro, localizados na divisa de estados de elevada incidência, estudos desenvolvidos têm identificado roedores reservatórios infectados com hantavírus patogênicos, levando a uma série de questionamentos que, até a presente data, não pode ser respondido. O objetivo principal deste trabalho foi contribuir para o conhecimento da diversidade genética dos hantavírus identificados no Brasil a partir das sequências completas do segmento genômico S. Inicialmente um levantamento foi realizado em bases de dados on-line (GenBank®) visando à obtenção das sequências completas de nucleotídeos do segmento S dos diferentes hantavírus, com ênfase nas sequências brasileiras. De um total de 334 sequências recuperadas, somente 14 sequências foram de hantavírus brasileiros sendo 12 delas do genótipo Araucária (Juquitiba) e duas do genótipo Araraquara, todas recuperadas de amostras humanas. Diante deste resultado, amostras biológicas de animais sororreativos acondicionadas no Laboratório de Hantavíroses e Rickettsioses IOC FIOCRUZ foram selecionadas e submetidas à PCR. Para isso, iniciadores (primers) foram desenhados e desenvolvidos para amplificação de todo o segmento genômico S. O sequenciamento de 23 amostras de roedores silvestres em áreas endêmicas e não endêmicas, em sete estados brasileiros, possibilitou a (i) primeira descrição e caracterização molecular de um hantavírus no estado do Espírito Santo; (ii) a primeira descrição do genótipo Juquitiba no roedor da espécie Olygorizomys fornesi no Brasil; (iii) a primeira sequência completa do segmento S do genótipo Jaborá. Na avaliação filogenética foi observada, em caráter inédito, a ampla diversidade genética dos hantavírus brasileiros. Não foi possível visualizar um padrão de associação hospedeiro ou geográfico, corroborando com os resultados obtidos em estudos recentes disponíveis.