Obtenção de genomas bacterianos a partir de dados metagenômicos da usina hidrelétrica de Tucuruí

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Padilha, Marcos Daniel Mendes
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Pará; Universidade Federal do Pará, Instituto de Ciências Biológicas; Brasil; Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular
• Palavras-chave em Português: Adaptação microbiana; Metagenoma de lago; Bactérias de lagos de água doce; Bioquímica e metabolismo microbiano; Ciências Biológicas; Genética de microrganismos
• Link de acesso: https://deposita.ibict.br/handle/deposita/516

Tucuruí é a segunda maior Usina Hidrelétrica brasileira, o lago artificial no município de Tucuruí alterou o ecossistema da região. Muitos microrganismos de vida livre responsáveis pela degradação de biomassa, decomposição de matéria orgânica, ciclos biogeoquímicos, alguns de interesse clínico, estão adaptados para viver no reservatório do lago. Esta pesquisa tem por objetivo a obtenção de genomas bacterianos por dados metagenômicos e identificar perfis funcionais e metabolismos microbianos no lago. Amostras de água e sedimento foram coletadas no lago da Usina Hidrelétrica de Tucuruí nas camadas fótica, afótica e sedimentar da estação do montante do novo repartimento. Após a filtração em membrana de nitrocelulose as amostras de DNA foram extraídas. O sequenciamento de metagenoma total foi realizado na plataforma Ion ProtonTM. Utilizou-se o Megahit para a montagem dos metagenomas. ORFs foram previstas usando Prodigal e foi usado o BUSCO para as quantificações de métricas de completude para avaliação comparativa de ortólogos universais de cópia única. Os genomas montados em metagenomas foram classificados nos banco de dados. Os filos foram definidos em nível de gênero e espécie, onde foi encontrado uma microbiota diversa e extremamente conservada. O perfil funcional dos metagenomas encontrados corroborou com outros estudos de metagenomas de lagos oligotróficos, demonstrando alta atividade bioquímica, conservada e diversa, sendo um estudo pioneiro ao montar os primeiros metagenomas de amostras da Usina Hidrelétrica de Tucuruí.