Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2018 |
| Autor(a) principal: |
Ramos, Thiago Giannini |
| Orientador(a): |
Silva, Fabricio Alves Barbosa da,
Menezes, Márcio Argollo Ferreira de |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Link de acesso: |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/29528
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Resumo: |
As altas taxas de mortalidade e morbidade associadas a infecções nosocomiais (adquiridas em ambientes hospitalares) causadas por bactérias multi-resistentes a antibióticos constituem um problema de saúde pública no Brasil. Nesta dissertação estudou-se um desses patógenos, Pseudomonas aeruginosa, cuja cepa altamente virulenta CCBH4851 está presente em vários hospitais públicos brasileiros. A partir de dados genômicos desta cepa, gerados no Laboratório de Pesquisa em Infecção Hospitalar do Instituto Oswaldo Cruz (LAPIH/IOC/FIOCRUZ), e de modelos computacionais que integram a visão sistêmica de processos celulares a informação no nível molecular, a pesquisa realizada objetivou reconstruir a rede metabólica da P. aeruginosa CCBH4851. Para auxiliar o processo de reconstrução foram criados dois sistemas WEB: o primeiro obtém um mapa metabólico inicial da CCBH4851 a partir da coleção de seus genes anotados e armazenados em um arquivo de extensão GBK e o mapa de referência da cepa PAO1. O segundo sistema auxilia na curadoria manual do mapa reconstruído a partir da criação de um espaço virtual para discussão com especialistas. Entre os resultados obtidos com a aplicação desta metodologia, destacam-se: 1) primeira reconstrução do mapa metabólico da P. aeruginosa CCBH4851 capaz de gerar biomassa; 2) adaptação do protocolo T&P para possibilitar tal reconstrução; 3) os sistemas web que possibilitaram tais resultados; 4) uma base de conhecimento para armazenamento de informações dos modelos reconstruídos. Com estes resultados, espera-se ter contribuído para a geração de modelos futuros da P. aeruginosa CCBH4851 que auxiliem na descoberta de novas opções terapêuticas. |
