Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2017 |
| Autor(a) principal: |
Morgado, Sergio Mascarenhas |
| Orientador(a): |
Vicente, Ana Carolina Paulo,
Marin, Michel Francisco Abanto |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Link de acesso: |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/19693
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Resumo: |
O gênero Mycobacterium é diverso e ubíquo no ambiente, com quase 200 espécies descritas. As espécies são classificadas como de crescimento rápido ou lento e, em ambos os grupos, existem espécies patogênicas e patógenos oportunistas. O solo da Mata Atlântica apresenta uma significativa diversidade bacteriana e uma pequena parte dessa diversidade está preservada na Coleção de Bactérias da Mata Atlântica - CBMA/FIOCRUZ, incluindo isolados do gênero Mycobacterium. Neste estudo caracterizamos a diversidade de micobactérias da coleção CBMA utilizando a informação genômica global, tendo como objetivo sua taxonomia e caracterização do resistoma. Utilizando a taxonomia genômica foram caracterizadas cinco novas espécies de micobactérias. Estas novas espécies são filogeneticamente relacionadas com as espécies M. septicum, M. llatzerense e M. abscessus. A análise das sequências genômicas permitiu também a caracterização do mobiloma, que compreende dois micobacteriófagos completos e cinco plasmídeos. A maioria desses elementos está nos genomas dos isolados CBMA 311/312/360, pertencentes a uma das novas espécies. Estes elementos são únicos considerando o repertório de mobilomas das micobactérias até agora identificado. Este estudo corrobora o solo da Mata Atlântica como um reservatório da diversidade de micobactérias, uma vez que, pelo menos cinco novas espécies e micobacteriófagos deste gênero, foram caracterizados As análises in silico do resistoma identificaram de dezenas a centenas de genes/mecanismos relacionados à resistência aos antibióticos, dependendo da base de dados utilizada. Para associar genótipo com fenótipo, genes relacionados a três mecanismos de resistência foram analisados: proteção de alvo (genes mfpA/B), modificação de antibióticos (gene arr) e degradação (gene de beta-lactamase). As análises in vitro destes genes, em sistema heterólogo, mostraram que estes alelos mfpA/B conferiam uma redução da sensibilidade às quinolonas; e o gene da beta-lactamase (bla326) apresentou um espectro de atividade restrito aos beta-lactâmicos; e o gene arr não alterou o perfil de sensibilidade à rifampicina. Portanto, para associar um gene/mecanismo à um perfil de resistência a antibióticos, é importante que a predição pela bioinformática, mesmo baseada em análises de genoma completo, seja validada com ensaios in vitro |
