Escolha de descritores mínimos e estabelecimento de coleções nucleares em Capsicum spp.
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| Автор: | |
|---|---|
| Дата публікації: | 2008 |
| Формат: | Doctoral thesis |
| Мова: | por |
| Джерело: | Repositório Institucional da UFG |
| Download full: | http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/435 |
Резюме: | The plant genetic diversity is a valuable guarantee for possible adversities that can be risking the survival of biological species. Brazil is one of the richest countries in biodiversity of plants, with about 20% of all the existing biodiversity on Earth and around 19% of the agricultural lands in the world. Genetic resources are studied in well-defined stages, such as collecting or introduction, multiplication, preservation/conservation, evaluation/characterization and use. In Brazil, the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária manages a national system of curatorship of genetic resources in which more than 250 thousand samples of plants, animals and microorganisms are preserved. The plants of the genus Capsicum (chilli and sweet peppers) are found throughout the national territory, presenting countless kinds, with a great phenotypic and genotypic diversity. Practically all the brazilian states have their own cultivars, but some of them, can be in fact, considered a mere duplicate because, sometimes, the same cultivar is known under different names. Thus, the morphological characterization is a task of great importance to this plant genus so, it is possible to avoid the conservation and maintenance of accessions of similar genomic patterns in germplasm banks. Embrapa Hortaliças has a collection of germplasm of sweet and chilli peppers (Capsicum spp.), which amounts to about 2,500 accessions. These mainly belong to the species C. annuum, C. baccatum, C. chinense and C. frutescens. The morphological characterization of most of these acessions (893) have been carried out in recent years for a series of characters (descriptors) which allow the investigation of the structure of their genetic variability and, from then the proposition of strategies to handle the collection. Considering the need of studies aiming to know, value and use the accessions of the Capsicum spp. Embrapa Hortaliças collection, this research was developed with the objective of describing the accessions and the descriptors available in this collection, in order to search for minimum descriptors and propose core collections for this germplasm bank. The study demonstrated that it is possible to reduce around 50% the number of descriptors currently used in the characterization of the accessions, without significant harm to the representation of the genetic variability of the collection. The factorial correspondence analysis showed to be appropriate for the selection of minimum descriptors, as well as to the proposition of core collections from germplasm banks, characterized, predominantly, by qualitative data. Variables related to the fruit showed great variability in all the germplasm collection, demonstrating that these attributes are important in the genetic discrimination among the accessions. The study also showed that the geographical origin, regardless of the species, is directly associated with the genetic divergence among the accessions in Capsicum spp. |
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In Brazil, the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária manages a national system of curatorship of genetic resources in which more than 250 thousand samples of plants, animals and microorganisms are preserved. The plants of the genus Capsicum (chilli and sweet peppers) are found throughout the national territory, presenting countless kinds, with a great phenotypic and genotypic diversity. Practically all the brazilian states have their own cultivars, but some of them, can be in fact, considered a mere duplicate because, sometimes, the same cultivar is known under different names. Thus, the morphological characterization is a task of great importance to this plant genus so, it is possible to avoid the conservation and maintenance of accessions of similar genomic patterns in germplasm banks. Embrapa Hortaliças has a collection of germplasm of sweet and chilli peppers (Capsicum spp.), which amounts to about 2,500 accessions. These mainly belong to the species C. annuum, C. baccatum, C. chinense and C. frutescens. The morphological characterization of most of these acessions (893) have been carried out in recent years for a series of characters (descriptors) which allow the investigation of the structure of their genetic variability and, from then the proposition of strategies to handle the collection. Considering the need of studies aiming to know, value and use the accessions of the Capsicum spp. Embrapa Hortaliças collection, this research was developed with the objective of describing the accessions and the descriptors available in this collection, in order to search for minimum descriptors and propose core collections for this germplasm bank. The study demonstrated that it is possible to reduce around 50% the number of descriptors currently used in the characterization of the accessions, without significant harm to the representation of the genetic variability of the collection. The factorial correspondence analysis showed to be appropriate for the selection of minimum descriptors, as well as to the proposition of core collections from germplasm banks, characterized, predominantly, by qualitative data. Variables related to the fruit showed great variability in all the germplasm collection, demonstrating that these attributes are important in the genetic discrimination among the accessions. The study also showed that the geographical origin, regardless of the species, is directly associated with the genetic divergence among the accessions in Capsicum spp.A diversidade genética vegetal representa uma inestimável garantia às possíveis adversidades que estejam colocando em risco a sobrevivência das espécies biológicas. O Brasil é um dos países mais ricos em diversidade biológica de plantas, possuindo cerca de 20% de toda a biodiversidade existente no planeta e cerca de 19% dos solos agricultáveis do mundo. Os recursos genéticos são estudados em etapas bem definidas, tais como, coleta ou introdução, multiplicação, preservação/conservação, avaliação/caracterização e uso. No Brasil, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária gerencia um sistema nacional de curadoria de recursos genéticos, em que mais de 250 mil amostras de plantas, animais e microrganismos são conservadas. As plantas do gênero Capsicum (pimentas e pimentões) são encontradas em todo território nacional, apresentando uma infinidade de formas, com grande diversidade fenotípica e genotípica. Praticamente todos os estados brasileiros possuem cultivares próprias, porém, muito provavelmente, parte do que se conhece pode tratar-se de mera duplicata, visto ocorrerem diversas cultivares iguais com nomes diferentes. Dessa forma, a caracterização morfológica constitui uma tarefa de grande importância para esse gênero vegetal, para evitar a conservação e manutenção de acessos de formas genômicas semelhantes em bancos de germoplasma. A Embrapa Hortaliças possui uma coleção de germoplasma de pimentas e pimentões (Capsicum spp.) que conta, atualmente, com cerca de dois mil e quinhentos acessos. Estes pertencem principalmente às espécies C. annuum, C. baccatum, C. chinense e C. frutescens. A caracterização morfológica de grande parte desses acessos (893 acessos) tem sido feita ao longo dos últimos anos, para uma série de caracteres (descritores) que permitem investigar a estrutura de sua variabilidade genética e, a partir daí, propor estratégias de manejo da coleção. Considerando-se a necessidade de estudos visando conhecer, valorizar e utilizar os acessos da coleção de Capsicum spp. da Embrapa Hortaliças, desenvolveu-se este trabalho com o objetivo de descrever os acessos e os descritores disponíveis nessa coleção, de forma a buscar descritores mínimos e propor coleções nucleares para o banco de germoplasma. O estudo demonstrou que é possível reduzir, em cerca de 50%, o número de descritores atualmente utilizados na caracterização dos acessos, sem prejuízo significativo à representação da variabilidade genética da coleção. A análise fatorial de correspondência demonstrou ser apropriada para a seleção de descritores mínimos, bem como para a proposição de coleções nucleares a partir de bancos de germoplasma que se encontram caracterizados, predominantemente, com dados de natureza qualitativa. As variáveis relacionadas ao fruto apresentaram grande variabilidade em toda a coleção de germoplasma, demonstrando-se que esses atributos são importantes na discriminação genética entre os acessos. O estudo revelou, também, que a origem geográfica, independentemente da espécie, tem associação direta com a divergência genética entre os acessos em Capsicum spp.application/pdfhttp://repositorio.bc.ufg.br/TEDE/retrieve/2903/WALDIR%20CAMARGOS%20JuNIOR.pdf.jpgporUniversidade Federal de GoiásDoutorado em AgronomiaUFGBRCiências AgráriaspimentagermoplasmaCapsicumanálise de correspondênciaanálise de agrupamento1.Pimenta 2.Germoplasma 3.Capsicum 4.Análise de correspondência 5.Análise de agrupamentochilli peppergermplasmCapsicumcorrespondence analysiscluster analysisCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETALEscolha de descritores mínimos e estabelecimento de coleções nucleares em Capsicum spp.Choice of minimum descriptors and establishment of Capsicum spp. core collectionsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFGinstname:Universidade Federal de Goiás (UFG)instacron:UFGORIGINALWALDIR CAMARGOS JuNIOR.pdfapplication/pdf2631108http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/a17c104a-2282-42e5-bafe-7e6d00b13f9d/downloadc08dda26b9fe6ea085335d05b2827a16MD51TEXTWALDIR CAMARGOS JuNIOR.pdf.txtWALDIR CAMARGOS JuNIOR.pdf.txtExtracted Texttext/plain310379http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/ed87ae49-c8ef-4a56-99ca-41a51c670441/download9c913b7e072482acc9408ace4e5d132bMD52THUMBNAILWALDIR CAMARGOS JuNIOR.pdf.jpgWALDIR CAMARGOS JuNIOR.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1952http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/500015fe-db79-4e69-9962-acc79144c6f8/downloade5901279acc10614e4cda021f0e3dc33MD53tde/4352014-07-30 03:00:59.41open.accessoai:repositorio.bc.ufg.br:tde/435http://repositorio.bc.ufg.br/tedeRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.bc.ufg.br/tedeserver/oai/requestgrt.bc@ufg.bropendoar:oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/12342014-07-30T06:00:59Repositório Institucional da UFG - Universidade Federal de Goiás (UFG) |
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