Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lesbon, Jéssika Cristina Chagas
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-03032023-155953/
Resumo: Apesar dos avanços nas abordagens diagnósticas e terapêuticas, muitos pacientes com câncer de pulmão ainda evoluem para estágios avançados com lesões metastáticas e óbito. Assim, novas terapias visando mecanismos epigenéticos relacionados aos processos metastáticos são muito importantes para o controle de genes específicos do câncer. Neste estudo, selecionamos uma pequena biblioteca de inibidores epigenéticos em linhagens de células de câncer de pulmão de células não- pequenas (CPCNP) e avaliamos 38 potenciais alvos epigenéticos no CPCNP metastático. Os potenciais candidatos foram classificados por uma abordagem simplificada usando experimentos in silico e in vitro com base em bancos de dados publicamente disponíveis e avaliados por expressão do gene alvo qPCR em tempo real, ensaios de viabilidade celular e invasão, e análise transcriptômica. A taxa de sobrevida dos pacientes com adenocarcinoma pulmonar é inversamente correlacionada com a expressão gênica de oito potenciais alvos epigenéticos, e uma revisão sistemática da literatura confirmou que quatro deles já foram identificados como alvos para o tratamento do CPCNP. Usando doses não citotóxicas dos inibidores selecionados, KDM6A/B (lysine demethylase 6A e 6B) e PADI4 (protein-arginine deiminase Type-4) foi avaliado que ambos afetam a atividade de invasão e migração de linhagens de células de câncer de pulmão metastático. A análise transcriptômica das células tratadas com KDM6A/B e PADI4 mostrou expressão alterada de genes importantes relacionados ao processo metastático. Em conclusão, mostramos que KDM6B e PADI4 são alvos promissores para inibir a metástase de células tumorais de adenocarcinoma pulmonar.
id USP_5da8b4619946e63b37a0f47cf765e9d6
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-03032023-155953
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenasDetermination of potential epigenetic therapeutic targets in non-small cell lung cancerAlvos epigenéticosCâncer de pulmãoCPCNPEpigenetic targetsKDM6BKDM6BLung cancerMetástaseMetastasisNSCLCPADI4PADI4Apesar dos avanços nas abordagens diagnósticas e terapêuticas, muitos pacientes com câncer de pulmão ainda evoluem para estágios avançados com lesões metastáticas e óbito. Assim, novas terapias visando mecanismos epigenéticos relacionados aos processos metastáticos são muito importantes para o controle de genes específicos do câncer. Neste estudo, selecionamos uma pequena biblioteca de inibidores epigenéticos em linhagens de células de câncer de pulmão de células não- pequenas (CPCNP) e avaliamos 38 potenciais alvos epigenéticos no CPCNP metastático. Os potenciais candidatos foram classificados por uma abordagem simplificada usando experimentos in silico e in vitro com base em bancos de dados publicamente disponíveis e avaliados por expressão do gene alvo qPCR em tempo real, ensaios de viabilidade celular e invasão, e análise transcriptômica. A taxa de sobrevida dos pacientes com adenocarcinoma pulmonar é inversamente correlacionada com a expressão gênica de oito potenciais alvos epigenéticos, e uma revisão sistemática da literatura confirmou que quatro deles já foram identificados como alvos para o tratamento do CPCNP. Usando doses não citotóxicas dos inibidores selecionados, KDM6A/B (lysine demethylase 6A e 6B) e PADI4 (protein-arginine deiminase Type-4) foi avaliado que ambos afetam a atividade de invasão e migração de linhagens de células de câncer de pulmão metastático. A análise transcriptômica das células tratadas com KDM6A/B e PADI4 mostrou expressão alterada de genes importantes relacionados ao processo metastático. Em conclusão, mostramos que KDM6B e PADI4 são alvos promissores para inibir a metástase de células tumorais de adenocarcinoma pulmonar.Despite advances in diagnostic and therapeutic approaches for lung cancer, many patients still progress to advanced stages, with metastatic lesions and death. Thus, new therapies targeting metastasis by the specific regulation of cancer genes are needed. In this study, we screened a small library of epigenetic inhibitors in non-small-cell lung cancer (NSCLC) cell lines and evaluated 38 potential epigenetic targets for their role in metastatic NSCLC. The potential candidates were ranked by a streamlined approach using in silico and in vitro experiments based on publicly available databases, and evaluated by real-time qPCR target gene expression, cell viability and invasion assays, and transcriptomic analysis. The survival rate of patients with lung adenocarcinoma is inversely correlated with the gene expression of eight potential epigenetic targets, and a systematic review of the literature confirmed that four of them have already been identified as targets for the treatment of NSCLC. Using nontoxic doses of the remaining inhibitors, KDM6A/B (lysine demethylase 6A e 6B) and PADI4 (protein-arginine deiminase Type-4) were identified as potential targets affecting the invasion and migration of metastatic lung cancer cell lines. Transcriptomic analysis of KDM6A/B and PADI4 treated cells showed altered expression of important genes related to the metastatic process. In conclusion, we showed that KDM6B and PADI4 are promising targets for inhibiting the metastasis of lung adenocarcinoma cancer cells.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFukumasu, HeidgeLesbon, Jéssika Cristina Chagas2022-10-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-03032023-155953/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-03-06T17:04:48Zoai:teses.usp.br:tde-03032023-155953Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-03-06T17:04:48Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
Determination of potential epigenetic therapeutic targets in non-small cell lung cancer
title Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
spellingShingle Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
Lesbon, Jéssika Cristina Chagas
Alvos epigenéticos
Câncer de pulmão
CPCNP
Epigenetic targets
KDM6B
KDM6B
Lung cancer
Metástase
Metastasis
NSCLC
PADI4
PADI4
title_short Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
title_full Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
title_fullStr Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
title_full_unstemmed Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
title_sort Determinação de potenciais alvos terapêuticos epigenéticos em câncer de pulmão de células não-pequenas
author Lesbon, Jéssika Cristina Chagas
author_facet Lesbon, Jéssika Cristina Chagas
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Fukumasu, Heidge
dc.contributor.author.fl_str_mv Lesbon, Jéssika Cristina Chagas
dc.subject.por.fl_str_mv Alvos epigenéticos
Câncer de pulmão
CPCNP
Epigenetic targets
KDM6B
KDM6B
Lung cancer
Metástase
Metastasis
NSCLC
PADI4
PADI4
topic Alvos epigenéticos
Câncer de pulmão
CPCNP
Epigenetic targets
KDM6B
KDM6B
Lung cancer
Metástase
Metastasis
NSCLC
PADI4
PADI4
description Apesar dos avanços nas abordagens diagnósticas e terapêuticas, muitos pacientes com câncer de pulmão ainda evoluem para estágios avançados com lesões metastáticas e óbito. Assim, novas terapias visando mecanismos epigenéticos relacionados aos processos metastáticos são muito importantes para o controle de genes específicos do câncer. Neste estudo, selecionamos uma pequena biblioteca de inibidores epigenéticos em linhagens de células de câncer de pulmão de células não- pequenas (CPCNP) e avaliamos 38 potenciais alvos epigenéticos no CPCNP metastático. Os potenciais candidatos foram classificados por uma abordagem simplificada usando experimentos in silico e in vitro com base em bancos de dados publicamente disponíveis e avaliados por expressão do gene alvo qPCR em tempo real, ensaios de viabilidade celular e invasão, e análise transcriptômica. A taxa de sobrevida dos pacientes com adenocarcinoma pulmonar é inversamente correlacionada com a expressão gênica de oito potenciais alvos epigenéticos, e uma revisão sistemática da literatura confirmou que quatro deles já foram identificados como alvos para o tratamento do CPCNP. Usando doses não citotóxicas dos inibidores selecionados, KDM6A/B (lysine demethylase 6A e 6B) e PADI4 (protein-arginine deiminase Type-4) foi avaliado que ambos afetam a atividade de invasão e migração de linhagens de células de câncer de pulmão metastático. A análise transcriptômica das células tratadas com KDM6A/B e PADI4 mostrou expressão alterada de genes importantes relacionados ao processo metastático. Em conclusão, mostramos que KDM6B e PADI4 são alvos promissores para inibir a metástase de células tumorais de adenocarcinoma pulmonar.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-10-20
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-03032023-155953/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-03032023-155953/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1826318389022294016