Caracterização genética de duas populações de Rhamdia quelen através da utilização de marcadores microssatélites
| Autor(a) principal: | |
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| Data de Publicação: | 2017 |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Idioma: | por |
| Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
| Texto Completo: | http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/10275 |
Resumo: | The catfish Rhamdia quelen stands out as a native species of economic interest for the southern region of Brazil, being the same one indicated as promising candidate for insertion in programs of genetic improvement. The success of the implementation of breeding programs is based on the formation of the base population, where one must pay attention to the genetic variability of the breeding stock and which usually come from wild populations. Therefore, the objective of this study was to genetically evaluate two natural populations of catfish from the Mirim and Mangueira lagoons in order to subsidize studies that effectively aim at the genetic improvement of this species. A total of 40 animals were collected from each pond, where two sources of biological material were collected from each fish (fragment of muscle tissue and caudal fin). The extraction of genomic DNA was carried out by means of an in house and low cost genomic DNA extraction protocol in the two target populations, as well as the efficiency of the protocol in the two sources of biological material collected. Eight microsatellite specific loci of the species were selected for PCR amplification, with the criterion of their choice being the existence of a motif of tetranucleotide repeat, following the trend of international forensic analysis (ISFG), which points to the motif as the most robust and reliable for genetic analyzes. The extraction protocol was effective for both sources of biological material, presenting samples with good quality DNA, without indicative of degradation, protein excess or contamination. Likewise, the 8 selected loci amplified for the two study populations, with good quality amplicons, being the same ones suitable for use as a tool in the genetic analysis of catfish, aiming at its improvement. |
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Caracterização genética de duas populações de Rhamdia quelen através da utilização de marcadores microssatélitesGenetic characterization of two populations of Rhamdia quelen through the use of microsatellite markersZootecniaPeixes - CriaçãoMelhoramento genéticoJundiá(Peixe)CIENCIAS AGRARIASZOOTECNIAThe catfish Rhamdia quelen stands out as a native species of economic interest for the southern region of Brazil, being the same one indicated as promising candidate for insertion in programs of genetic improvement. The success of the implementation of breeding programs is based on the formation of the base population, where one must pay attention to the genetic variability of the breeding stock and which usually come from wild populations. Therefore, the objective of this study was to genetically evaluate two natural populations of catfish from the Mirim and Mangueira lagoons in order to subsidize studies that effectively aim at the genetic improvement of this species. A total of 40 animals were collected from each pond, where two sources of biological material were collected from each fish (fragment of muscle tissue and caudal fin). The extraction of genomic DNA was carried out by means of an in house and low cost genomic DNA extraction protocol in the two target populations, as well as the efficiency of the protocol in the two sources of biological material collected. Eight microsatellite specific loci of the species were selected for PCR amplification, with the criterion of their choice being the existence of a motif of tetranucleotide repeat, following the trend of international forensic analysis (ISFG), which points to the motif as the most robust and reliable for genetic analyzes. The extraction protocol was effective for both sources of biological material, presenting samples with good quality DNA, without indicative of degradation, protein excess or contamination. Likewise, the 8 selected loci amplified for the two study populations, with good quality amplicons, being the same ones suitable for use as a tool in the genetic analysis of catfish, aiming at its improvement.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESO jundiá Rhamdia quelen destaca-se como uma espécie nativa de interesse econômico para região sul do Brasil, sendo a mesma apontada como promissora candidata para inserção em programas de melhoramento genético. O sucesso da implementação de programas de melhoramento está embasado na formação da população base, onde deve-se atentar para a variabilidade genética dos plantéis formadores e que normalmente são oriundos de populações selvagens. Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar geneticamente duas populações naturais de jundiás oriundos das lagoas Mirim e Mangueira a fim de subsidiar estudos que visem efetivamente o melhoramento genético desta espécie em questão. Foram capturados 40 animais de cada lagoa, onde foram coletadas duas fontes de material biológico de cada peixe (fragmento de tecido muscular e nadadeira caudal). A extração de DNA genômico foi realizada mediante um protocolo de extração de DNA genômico in house e de baixo custo nas duas populações alvo, bem como aferida a eficiência do protocolo nas duas fontes de material biológico coletadas. Foram selecionados 8 loci microssatélites específicos da espécie para amplificação via PCR, tendo como critério de escolha dos mesmos a existência de motivo de repetição unicamente tetranucleotídeo, seguindo a tendência de análise forense internacional (ISFG), que aponta o motivo como o mais robusto e confiável para análises de cunho genético. O protocolo de extração mostrou-se eficaz para ambas fontes de material biológico, apresentando amostras com DNA integro, sem indicativos de degradação, excesso protéico ou contaminação. De igual forma, os 8 loci selecionados amplificaram para as duas populações de estudo, com amplicons de boa qualidade, sendo os mesmos adequados para utilização como ferramenta na análise genética do jundiá, visando seu melhoramento.Universidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaUFPelBrasilhttp://lattes.cnpq.br/8982102154251619http://lattes.cnpq.br/2694556140624639Dionello, Nelson José LaurinoFreitas, Suzane Fonseca2023-10-09T17:58:28Z2023-10-09T17:58:28Z2017-02-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfFREITAS, Suzane Fonseca. Caracterização genética de duas populações de Rhamdia quelen através da utilização de marcadores microssatélites. 2017. 82f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) – Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2017.http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/10275porCC BY-NC-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPEL2023-10-10T06:02:09Zoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/10275Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-10-10T06:02:09Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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