Processamento e análise de dados de Ressonância Magnética funcional (RMf) em repouso e tensor de difusão (DTI)

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Main Author: Lopes, Vanda Carolina da Silva
Publication Date: 2013
Format: Master thesis
Language: por
Source: Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
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Summary: Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Biomédica (área de especialização em Informática Médica)
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spelling Processamento e análise de dados de Ressonância Magnética funcional (RMf) em repouso e tensor de difusão (DTI)681.3:6161:681.3616-073616.8Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Biomédica (área de especialização em Informática Médica)Os estudos de conectividade cerebral têm-se tornado bastante relevantes no meio científico e clinico. No entanto, estes estudos não são fáceis de realizar, uma vez que as aplicações existentes foram desenvolvidas por investigadores para as suas necessidades, não sendo apropriadas para um profissional de saúde. Assim, foi criada a aplicação BrainCAT que permite que os estudos de conectividade cerebral de Ressonância Magnética funcional e tensor de difusão sejam realizados de forma intuitiva e que seja facilmente manuseada por um utilizador com poucos conhecimentos na área. Assim, o objetivo desta dissertação centra-se na aplicação BrainCAT. Assim, esta dissertação pode ser dividida em cinco parte: teste da aplicação com um número elevado de casos, levantamento de falhas e de formas de melhorar a aplicação, implementação das melhorias através da programação em objective-C, testar novamente a aplicação para os mesmos casos e, por fim, comparar os resultados das duas análises. As melhorias implementadas baseiam-se em formas de tornar a aplicação mais intuitiva e de melhorar os resultados. A nível de melhorias de resultados centrou-se na etapa da normalização, uma vez que esta era a que apresentava mais problemas. Assim, entre outras implementações, foram adicionadas etapas como a remoção do pescoço, a verificação da extração do crânio na imagem estrutural e a normalização não linear. Relativamente à comparação entre resultados, verificou-se que com a extração do pescoço da imagem estrutural, a etapa seguinte de extração do crânio melhorou. A verificação do resultado desta imagem, facilita o utilizador e previne que casos não sejam vistos. A normalização linear apresentou resultados melhores, contudo apresenta uma maior sensibilidade a artefactos ou erros de pré-processamento.Brain connectivity studies have become relatively relevant in the scientific and clinical fields. However, these studies are complex, since existing applications have been developed by researchers for their needs and they are not appropriate for a healthcare professional. Thus was created the application BrainCAT that allows studying brain connectivity in functional MRI and diffusion tensor imaging, intuitively and easily handled by a user with little knowledge in the area. The objective of this dissertation is to test the application BrainCAT. This dissertation can be divided into five parts: testing the application with a large number of cases, review of failures and ways to improve the application, implementation of improvements by programming in Objective-C, test the application again for the same cases and, ultimately, comparing the results of the two analyzes. The improvements were made based on how to make the application more intuitive and improve results. At the level of improvement, results focused on the stage of normalization, since it showed that have more problems. Thus, among other implementations were added steps as neck removal, check the extraction in the structural image of the skull and non-linear normalization. Concerning the comparison results, it was found that with the extraction of the neck in the structural image, the step of extracting the skull was improved. The verification of the skull stripping facilitates the user and prevents cases of not beeing analyzed. The linear normalization showed better results, but is more sensitive to artifacts and errors in preprocessing.Alves, VictorSoares, JoséUniversidade do MinhoLopes, Vanda Carolina da Silva20132013-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/1822/27794por201186462info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2024-05-11T06:26:07Zoai:repositorium.sdum.uminho.pt:1822/27794Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-28T15:53:04.147223Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse
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