Lisinas codificadas por profagos de Acinetobacter baumannii

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Main Author: Silva, Maria Leonor Raposo Vieira da
Publication Date: 2023
Format: Master thesis
Language: por
Source: Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
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Summary: Tese de mestrado, Microbiologia Aplicada, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências
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spelling Lisinas codificadas por profagos de Acinetobacter baumanniiAcinetobacter baumanniiresistência a antibióticosprofagos(endo)lisinaslise a partir do exteriorTeses de mestrado - 2023Departamento de Biologia VegetalTese de mestrado, Microbiologia Aplicada, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasAcinetobacter baumannii é um agente patogénico Gram-negativo, oportunista e responsável pela maioria das infeções nosocomiais em todo o mundo. Nos últimos anos, este microrganismo tem adquirido resistência aos diversos antibióticos comercializados, sendo maioritariamente auxiliado pelos seus fatores de virulência, pela excelente capacidade de resistir à dessecação, desinfeção e stress oxidativo, pela capacidade de formar biofilmes, por se mover pelas superfícies e por ser capaz de adquirir DNA exógeno. Particularmente, A. baumannii resistente a carbapenemos (CRAB), foi decretado pela Organização Mundial de Saúde (OMS) como um microrganismo prioritário que requer atenção e o desenvolvimento imperativo de novas opções terapêuticas. As (endo)lisinas fágicas apresentam-se como uma opção promissora, uma vez que são responsáveis por clivar as ligações no peptidoglicano a partir do interior, levando à lise das células hospedeiras durante o ciclo lítico do fago. Sabe-se que a aplicação de endolisinas a partir do exterior e diretamente em bactérias Gram-positivas provoca a sua lise e que, teoricamente, o mesmo não é esperado quando aplicadas em bactérias Gram-negativas devido à presença da membrana externa. Esta barreira poderá ser ultrapassada através da encapsulação das endolisinas em lipossomas, tirando partido da fusão desta estrutura com a membrana externa da bactéria. Contrariamente ao expectável, já foram relatadas algumas lisinas com atividade bactericida intrínseca direta contra A. baumannii. Os profagos (genomas fágicos integrados) em genomas de A. baumannii constituem uma fonte acessível para a pesquisa destas proteínas. Da análise dos 199 genomas de A. baumannii considerados neste projeto, foram detetados 373 profagos putativos e 311 lisinas putativas codificadas na totalidade das regiões profágicas identificadas. As lisinas selecionadas, AbCWH, AbLyso, AbPepti, AbProte e AbTail, foram clonadas e expressas com sucesso tendo todas apresentado atividade bactericida contra a bactéria Gram-positiva Micrococcus luteus. Em particular, AbTail apresentou atividade direta contra A. baumannii sendo a sua estrutura alvo de análise.Acinetobacter baumannii is a Gram-negative and opportunistic pathogen, responsible for most nosocomial infections worldwide. In recent years, this microorganism has acquired resistance to various antibiotics commercialized, being mostly promoted by its virulence factors, by the excellent ability to resist desiccation, disinfection and oxidative stress, by the ability to form biofilms, by moving across surfaces and by being able to acquire exogenous DNA. In particular, carbapenem-resistant A. baumannii, was decreed by the World Health Organization as a priority microorganism that requires attention and the imperative development of new therapeutic options. Phage (endo)lysins are a promising option to consider, since they are responsible for cleaving the peptidoglycan bonds from the inside, leading to lysis of the host cells during the lytic cycle of the phage. It is known that the application of endolysins from the outside and directly in Gram-positive bacteria causes its lysis and that, theoretically, the same is not expected when applied to Gram-negative bacteria due to the presence of the outer membrane. This barrier can be overcome by encapsulating endolysins in liposomes, taking advantage of the fusion of this structure with the outer membrane of the bacterium. Contrary to expectations, some lysins with direct intrinsic bactericidal activity against A. baumannii have been reported. The prophages (integrated phage genomes) in A. baumannii genomes constitute an accessible source for the research of these proteins. From the analysis of the 199 genomes of A. baumannii considered in this project, 373 putative prophages and 311 putative lysins were detected encoded in all the identified prophagic regions. The selected lysins, AbCWH, AbLyso, AbPepti, AbProte and AbTail, were cloned and successfully expressed and all presented bactericidal activity against the Gram-positive bacterium Micrococcus luteus. In particular, AbTail showed direct activity against A. baumannii being its structure explored later.Vale, Filipa F.Caeiro, Filomena, 1950-Repositório da Universidade de LisboaSilva, Maria Leonor Raposo Vieira da202320232026-08-31T00:00:00Z2023-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/61490TID:203525442porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2025-03-17T15:07:32Zoai:repositorio.ulisboa.pt:10451/61490Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-29T03:34:18.221733Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse
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