Validation of a customized subset of SNPs for sheep breed assignment in Brazil

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Main Author: Paim, Tiago do Prado
Publication Date: 2019
Other Authors: Pimentel, Concepta Margaret McManus, Vieira, Fábio Danilo, Oliveira, Stanley Robson de Medeiros, Facó, Olivardo, Azevedo, Hymerson Costa, Araújo, Adriana Mello de, Moraes, José Carlos Ferrugem, Yamagishi, Michel Eduardo Beleza, Carneiro, Paulo Luiz Souza, Caetano, Alexandre Rodrigues, Paiva, Samuel Rezende
Format: Article
Language: eng
Source: Repositório Institucional da UnB
Download full: https://repositorio.unb.br/handle/10482/36266
https://doi.org/10.1590/s1678-3921.pab2019.v54.00506
http://orcid.org/0000-0002-9486-7128
http://orcid.org/0000-0002-1106-8962
http://orcid.org/0000-0002-8686-3338
http://orcid.org/0000-0003-4879-7015
http://orcid.org/0000-0001-8313-9830
http://orcid.org/0000-0002-0187-9227
http://orcid.org/0000-0002-7458-0656
http://orcid.org/0000-0002-1230-9000
http://orcid.org/0000-0001-7109-3038
http://orcid.org/0000-0001-7708-6197
http://orcid.org/0000-0002-3419-7337
http://orcid.org/0000-0001-6687-2491
Summary: O objetivo deste trabalho foi avaliar a utilidade de um subconjunto de 18 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) para a certificação das raças de ovinos Crioula Brasileira, Morada Nova (MN) e Santa Inês (SI). Dados de 588 animais foram analisados com o programa Structure. Em 82% dos casos, observou-se designação racial correta com confiança acima de 90%. A maioria dos casos de designação incorreta de raça foi observada em MN e SI. Portanto, apesar de o subconjunto de 18 SNPs ter confiabilidade elevada, ele não é suficiente para a inequívoca certificação das raças estudadas, principalmente das deslanadas. É necessário o desenvolvimento de um painel mais preciso para uso amplo em certificação racial.